Barbara PAWLAK

Maître de Conférences HDR

Activités de recherche

Thématique générale :

Etude du dialogue moléculaire entre le microbiote rhizosphérique et le système racinaire des plantes.

Participation aux projets en cours suivants :

 Ø  Porteuse et coordinatrice du programme BEER “Bactéries, Exsudats Et Rhizodépôts” pour la SFR Normandie-Végétal - Responsable scientifique pour GlycoMEV

Dates du projet : 31.10.2019 - 30.10.2022 (3 ans)

Appel à projets : Appel à projets régionaux RIN 2019 (Réseaux d’Intérêts Normands) (novembre 2018) - Réponse à la modalité “RIN Tremplin”

Partenaires : cinq laboratoires et deux plateformes (+ un laboratoire associé)

Biologie : GlycoMEV (EA 4358 URN), EVA (UMR 950 INRAe - UCN), LMSM (EA 4312 URN), AGHYLE (UniLaSalle Rouen)

Chimie : COBRA (UMR 6014 CNRS - INSA - URN)

Imagerie : PRIMACEN (Plateforme Imagerie URN), CMAbio (Plateforme Imagerie - SF 4206 ICORE - UCN)

Associé au travail d’Imagerie : CRISMAT (UMR 6508 CNRS - ENSICAEN - UCN)

Objectifs : Apporter des éléments forts de compréhension sur les relations entre le système racinaire et les bactéries du microbiote rhizosphérique. En effet, améliorer notre capacité à guider l’assemblage des populations microbiennes bénéfiques autour des racines permettrait i) de limiter les apports chimiques aux cultures et ii) d’anticiper les effets néfastes des changements climatiques annoncés en renforçant les capacités d’adaptation des végétaux.

Moyens humains (GlycoMEV) : Eulalie Fourneau (doctorante - allocation doctorale ED NBISE - Concours 2021), Mélissa Pannier (ingénieure d’étude BEER 12 mois) et des stagiaires

Ø  Co-porteuse du programme de recherche i-Végétal “Immunité Végétale : rôle de la coiffe racinaire et de ses sécrétions dans la protection des plantes”

Co-porteur : Pr Azeddine Driouich (GlycoMEV)

Dates du projet : 01.10.2020 - 30.03.2024 (3,5 ans)

Partenaire : Centre Mondial de l’Innovation Roullier - Saint-Malo

Objectif : Etudier l’implication de différents polysaccharides et de l’ADN extracellulaire dans la structure et la fonction protectrice du RET (Root Extracellular Trap) via l’utilisation d’enzymes et de bactéries capables de déstructurer ces molécules. Le suivi des étapes de déconstruction nous renseignera sur le rôle et l’accessibilité des composants du réseau.

Moyens humains : Alexia Gaudry (doctorante - allocation doctorale régionale - RIN Doctorant 100% 2020) et des stagiaires

 

3- Encadrements de thèse en cours :

Ø  Co-direction de la thèse de Doctorat d’Alexia Gaudry :

 [Début de la thèse le 01.10.2020]

“Immunité Végétale : rôle de la coiffe racinaire et de ses sécrétions dans la protection des plantes”

- Laboratoire d’accueil : GlycoMEV

- Co-directeur de thèse : Pr Azeddine Driouich (GlycoMEV)

- Financement (salaire) : Allocation doctorale régionale (RIN Doctorants 100% 2020 - SFR Normandie-Végétal) - Projet i-Végétal

- Financement (fonctionnement) : Centre Mondial de l’Innovation Roullier - Saint-Malo - Projet i-Végétal

Ø  Co-direction de la thèse de Doctorat d’Eulalie Fourneau :

 [Début de la thèse le 01.10.2021]

“Réponses physiologiques et génétiques de sept bactéries bénéfiques ou phytopathogènes au contact des exsudats racinaires de différentes plantes d’intérêt"

- Laboratoire d’accueil : GlycoMEV

- Co-directrice de thèse : Isabelle Boulogne, MCF (GlycoMEV)

- Financement (salaire) : Allocation doctorale de l’Ecole Doctorale NBISE (concours 2021)

- Financement (fonctionnement) : Projet régional BEER (RIN Tremplin 2019)

Responsabilités scientifiques

Ø Porteuse et co-porteuse des projets scientifiques BEER et i-Végétal

Ø Co-direction de deux thèses en cours (Alexia Gaudry et Eulalie Fourneau)

Ø Membre du Conseil scientifique de la SFR Normandie-Végétal (FED 4277)

Ø Membre du Carnot i2C (innovation Chimie Carnot - Normandie-Université), secteur “Agroalimentaire et optimisation de l’utilisation des bioressources”

Ø Membre du Bureau de Direction du laboratoire GlycoMEV

Ø Membre de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne (AFEM)

Ø Membre de la Société Française de Microbiologie (SFM)

Responsabilités administratives

Ø Responsabilité ou co-responsabilité d’UE :

- UE “Microbiologie” : L2 BGE (S4) - Tronc commun

- UE “Génétique des microorganismes” : L3B2MCP (S5) - Tronc commun

- UE “Contrôle microbiologique et Diagnostic moléculaire” : L3 B2MCP (S5) - Option

- UE “Contrôles microbiologiques” : LP CAB (S5) - Tronc commun

Ø Membre des jurys et des Commissions pédagogiques d’optimisation en L2 BGE, LP CAB et L3 B2MCP.

Responsabilités pédagogiques

Ø Membre du Conseil Académique (CAc) de la ComUE Normandie-Université (NU)

Ø Membre de la Commission Recherche du CAc de la ComUE NU                                         

Membre du Département de Biologie de l’UFR des Sciences et Techniques de l’URN

Ø Membre de la CCSE, 64-65ème section du CNU à l’URN

Mots-clés recherche

Microbiote rhizosphérique - Exsudats racinaires - Défense des plantes - Bactéries bénéfiques